O Herbário Nacional STP colabora com investigadores e instituições diversas em projectos de investigação e formação.
- Jardim Botânico da Universidade de Coimbra
- Herbário da Universidade de Coimbra
- Cátedra UNESCO em Biodiversidade e Conservação UC
- Centro de Ecologia Funcional
- Missouri Botanical Garden
- CIAT – Centro de Investigação Agronómica e Tecnológica
- Parque Natural Obô São Tomé
- Parque Natural Obô Príncipe
- Príncipe Trust